洁净手术室以室内微生物为控制目标，运行参数以及分级指标，空气洁净度是必要的保障条件。洁净手术室按洁净程度可分为以下几级：
1、特别洁净手术室：手术区洁净度为百级，周边区为千级。适用于烧伤、关节转换、器官移植、脑外科、眼科、整形外科及心脏外科等无菌手术；
2、洁净手术室：手术区洁净度为千级，周边区为万级，适用于胸外科、整形外、泌尿外科、肝胆胰外科、骨外科及取卵等无菌手术；
3、一般洁净手术室：手术区洁净度为万级，周边区为十万级，适用于普通外科、皮肤科及腹外科等手术；
4、准洁净手术室：空气洁净度为十万级，适用于产科、肛肠外科等手术。

洁净手术部用房除洁净度级另和细菌浓度应符合相应的级别外，有关的技术参数还应符合有关规定，见洁净手术部各级用房的主要技术参数表。洁净手术部的平面布局按照一般要求应分为洁净区与非洁净区两部分。